Administracja Krzesińskiego Parku Krajobrazowego prowadzi współpracę w zakresie edukacji z Muzeum Bociana Białego w Kłopocie. Uczestniczy także wspólnie z Muzeum i Zarządem Okręgu LOP w Zielonej Górze w programie ochrony bociana białego, w ramach którego m.in. instaluje się podstawy pod gniazda bocianie, prowadzi edukację ekologiczną oraz monitoring kolonii bociana białego we wsi Kłopot.
Wspólnie z Uniwersytetem Zielonogórskim prowadzone są badania do prac magisterskich i doktoranckich na terenie Parku.
Park współpracuje także z nadleśnictwami w zakresie ochrony przyrody, tworzenia infrastruktury turystycznej i przestrzegania prawa. Współpracuje także z instytucjami lokalnymi (samorządy, szkoły, organizacje turystyczne, stowarzyszenia.)